细菌性败血症因鱼体质差，水环境恶劣，感染速度快，容易迅速致死，鱼体反而表现出一种无症状化趋势，因此给诊断带来了很大的困难。这就要从发病规律上来进行诊断：
（1）细菌性败血症几乎危害所有淡水养殖鱼类(除草鱼有时例外)，故一旦发现池塘大量死亡两个或两个以上的品种鱼类时(除草鱼有时例外)，在排除了中毒、泛塘等情况之外，基本是可以诊断为细菌性败血症。
（2）淡水鱼类其他鱼病一般不危害野杂鱼，如餐条、麦穗鱼、黄颡鱼等，因此，一旦发现池塘中有这些野杂鱼死亡，而且死亡次序在其它鱼类之前，就基本上可以诊断为细菌性败血症了。
(3 )4、5月份为鲤、鲫大量繁殖季节，这些繁殖季节的鱼体质较弱，容易被感染，如发现鲤、鲫大量死亡，也可确诊为细菌性败血症。
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